关注我们,为您提供时实资讯
2026年11月11日 17:53 来源:https://xwcbio.com/index.php?id=836

——一篇细菌庚糖探针工作,把 Sulfo-CY5-alkyne 放在了读出的那一端
JACS Au 2026 年第 6 卷第 7 期,一篇做细菌庚糖的论文把 CuAAC 的读出端单独拎出来看了一遍。作者给革兰阴性菌喂一支带叠氮的庚糖代谢探针 7AzHep1P,让它掺进脂多糖,再用带炔基的荧光染料把掺进去的部分点出来,靠凝胶荧光读出。整套流程里值得抄的不是反应条件,而是那几组对照——它们回答了一个常被跳过的问题:胶上亮起来的条带,有多少来自目标分子,有多少来自染料本身。
Cao W, Liu W, Yang M, et al. Bioorthogonal Heptose Phosphate Probes for Chemical Profiling of Bacterial Glycans. JACS Au. 2026;6(7):3828–3842. DOI: 10.1021/jacsau.6c00391
庚糖是革兰阴性菌脂多糖内核绕不开的组分,也参与先天免疫的识别。要在细菌里追它,得先给它装一个能被化学抓住的把手:7-azido-heptose-1-phosphate 是一支带叠氮的庚糖-1-磷酸,细菌把它当原料掺进 LPS,掺进去之后,叠氮就留在糖链上。
剩下的工作交给 CuAAC。一价铜、还原剂、炔基染料,把荧光接到叠氮上,产物是稳定的三唑。这套配方在标记里用了快二十年,稳定到几乎不再被审视——一旦胶上出现不该有的条带,怀疑对象通常落在染料身上:浓度不够、批次不新、见光太久。
这篇工作把染料这一侧翻成了变量。它没有假设染料是“惰性的显色剂”,而是先问了一句:在水相体系里,这支带荧光的分子自己会往哪儿去?答案写在对照组里。
第一组是溶剂对照。 细菌不加探针,仅用溶解探针的溶剂处理,之后照走同一步点击反应。如果胶上还有条带,那这条带与庚糖无关,是染料自己在体系里留下的痕迹。
第二组换探针。 7AzHep 与 AMS-7AzHep1P 并行做完,两列的条带模式并不一致。这一组的分量在于:如果亮的是染料本身在乱结合,两种探针应该给出同样的图案;图案不同,说明信号跟着探针的代谢去向走。
第三组对齐上样量。 考马斯亮蓝染色归一蛋白量,“上得多所以亮”这条路先堵掉。
作者还主动交代了一处容易被忽略的地方:乙酰/SATE 保护基脱除不到位,会留下亲脂的中间体,这类中间体能在没有 LPS 的情况下被抓上荧光。也就是说,一旦体系里出现多余的疏水分子,假信号就会跟着出现。这条提醒放在整篇文章里并不起眼,却和后面要谈的染料选择是同一件事。
文字版对照
掺入条件,4 mM 探针、36 h,两种菌株信号随浓度上升,信号与掺入量挂钩;读出方式,CuAAC 接 sulfo-Cy5-Alkyne,SDS-PAGE 凝胶荧光,读出端走的是水相点击化学;信号位置,条带落在 3.3–20.1 kDa 区间,与 LPS 的分子量区间吻合;溶剂对照,不加探针、同一点击反应仍有背景,背景里有一部分属于染料;两种探针,条带模式不同,信号跟随探针,不跟随染料;糖蛋白组,133 个 O-庚糖化糖肽、97 个蛋白,低丰度样本里也能定位到位点
图1. 7AzHep1P 掺入 LPS、经 CuAAC 接 sulfo-Cy5-Alkyne、凝胶荧光读出的流程,以及信号随探针浓度上升的趋势(示意图,据 JACS Au 2026, Fig. 3 绘制)。
这张表里有一行容易被略过:溶剂对照。多数标记实验的对照是“不加一抗”“不加探针”,而这组对照把点击反应照做了一遍——它检验的不是有没有标记上,而是染料在这套体系里会自己亮成什么样。
另一行是糖蛋白组。133 个 O-庚糖化糖肽、97 个蛋白,这个量级说明磺化染料在低丰度样本里仍有可用的信噪;对照做得干净,后面的位点鉴定才有意义。
磺化这件事,常被说成“好溶”。对做标记的人,更准确的说法是:它把一支偏油的分子改成了带电的分子,于是它不再那么愿意往膜的脂相、蛋白的疏水口袋里钻。
同一年的另一项工作把这句话讲得更直白。Nature Communications 上那篇做糖萼的工作,把环炔弹头接到带电的荧光团上做成水溶性探针,并指出压低非极性的相互作用,可以抑制所谓的“observer effect”——探针自己改变了被观察的对象。作者在比较两种环炔时给出的 log P 是 3.5 与 0.7,疏水性的差别直接写在数字上。
Smits D, Damen JAM, Li T, et al. Glycocalyx micro- and nanodomains in cell-cell and cell-matrix interactions revealed by enhanced click chemistry. Nat Commun. 2026;17(1):2645. DOI: 10.1038/s41467-026-69242-1
Sulfo-CY5-alkyne 就在这条线上:CY5 母核两侧挂上磺酸基,整体带负电,炔基末端留着做点击化学。它在体系里要做的事很朴素——把荧光带到叠氮上,然后停在应该停的地方。
图2. 磺化与非磺化荧光团在水相中的分布差异示意:带电的分子更多留在水相,非磺化分子更容易分配到脂相与疏水界面(示意图,据 Nat Commun 2026, Fig. 1 思路绘制)。
接得住的是“读出”这一段。 文中用的是末端炔——一价铜催化、生成三唑,和 Sulfo-CY5-alkyne 属于同一类化学。磺酸基不参与这个反应,它管的是染料在水里的行为。所以那篇文章里关于“对照组怎么设、背景从哪来”的经验,可以直接搬到这支染料的使用上。
接不住的,要提前说清楚。 一,CuAAC 仍要一价铜,还原剂和配体省不掉,铜对活细胞的扰动这篇论文没有解决;二,磺化让分子偏水、不易穿膜,做胞内标记要单独评估进入效率,它更适合表面标记、裂解液标记和体外偶联;三,文中的体系是裂解液加凝胶读出,换到活菌表面标记,时间分辨和洗涤条件都得重新摸。
还有一条排错顺序。 胶上背景高,先看染料在体系里会往哪儿跑,再考虑换水溶性版本;换不了,加助溶剂、加配体;染料浓度放最后——提浓度的时候,信号和背景是一起抬的。至于“标不上”,先查对面那个叠氮,再查铜与还原剂,染料本身排在后面。
本研究涉及的水溶性花菁染料与配套试剂,新维创生物科技(重庆)有限公司可提供,规格可按体系调整。
文字版对照
Sulfo-CY5-alkyne 水溶性CY5-炔基(磺化CY5标记炔基),本文主角,水相 CuAAC 的炔基端;CAS 1617497-19-4,按规格出具(5 mg 起),5 / 10 / 50 / 100 mg,可定制;CY5-Alkyne 脂溶性CY5炔基,对照与替代:有机相体系或需要预溶时使用;CAS 1223357-57-0,Y0595001 / Y0595500,1 mg / 500 mg;CY5-N3 CY5叠氮,反向搭配:底物带炔、染料带叠氮;CAS 1782950-80-4,Y0495001 / Y0495005 / Y04951000,1 mg / 5 mg / 1 g;CY3-alkyne CY3炔基,双色实验:短波段通道做内参或共定位;CAS 2055138-87-7,Y0593010 / Y0593500 / Y05931000,10 mg / 500 mg / 1 g;Sulfo-Cy5-DBCO 水溶性CY5二苯基环辛炔,无铜路线:体系容不下一价铜时;CAS 1564286-24-3,按规格出具,5 / 10 / 50 / 100 mg;Sulfo-Cy5-NHS 水溶性CY5活化酯,正交路线:走氨基,不进点击体系,按规格出具,5 / 10 / 50 / 100 mg
水相体系直接用 Sulfo-CY5-alkyne;需要有机相预溶的对照跑 CY5-Alkyne;底物那一侧带炔基时,把染料换成 CY5-N3;双色实验里,CY3-alkyne 与 Sulfo-CY5-alkyne 分别在 550 nm 与 646 nm 附近激发,通道分得开;体系容不下铜,走 Sulfo-Cy5-DBCO 的 SPAAC。
一支染料在实验里能扮演的角色,通常被压缩成“显色”。这篇论文把角色还原了一点:它也是体系的一部分,会分配、会结合、会留下自己的痕迹。Sulfo-CY5-alkyne 的选择逻辑就在这里——不求更亮,而是把一类与目标无关的信号移出体系,让胶上的条带更接近样本本来的样子。
[1] Cao W, Liu W, Yang M, et al. Bioorthogonal Heptose Phosphate Probes for Chemical Profiling of Bacterial Glycans. JACS Au. 2026;6(7):3828–3842. DOI: 10.1021/jacsau.6c00391.
[2] Smits D, Damen JAM, Li T, et al. Glycocalyx micro- and nanodomains in cell-cell and cell-matrix interactions revealed by enhanced click chemistry. Nat Commun. 2026;17(1):2645. DOI: 10.1038/s41467-026-69242-1.
◆本文若对您有帮助,欢迎“一键三连”(点赞、爱心或转给有需要的科研同伴)
◆星标「新维创生物」,好物上新快一步,配标资料不落伍
ABOUT US · 关于我们
新维创生物科技(重庆)有限公司专注荧光分子定制,研发、生产、检测一体:染料覆盖 NIR-I 与 NIR-II 两个波段,配套荧光标记蛋白、多肽、多糖、磷脂与探针淬灭试剂,并可承接多肽定制合成、生物素标记与 HPLC 纯化检测,结果可靠。源头直供,现货常备,规格灵活;试标小样、中试放大与批量备货,可按阶段对接。染料结构与标记方案,亦可依体系调整。
秉持「品质优先,服务至上」,以光谱有据、批次有序,助力科技创新。
新维创生物科技(重庆)有限公司
2023.06.05
新维创生物科技(重庆)有限公司同位素产品系列上新
2026.07.06
Mannose-CY5甘露糖红色荧光标记多糖类化合物
2024.06.12
FITC-甘露糖Mannose-FITC异硫氰酸荧光素甘露糖荧光标记的优点
2024.05.28
DBCO-CY5与DBCO-CY7化学结构及性质差别/sulfo-cy5-dbco/sulfo-cy7-dbco
2024.05.27
DBCO-CY5荧光标记化合物点击化学反应的特性CY5-二苯并环辛炔2182601-71-2
2024.05.27
Cy5标记胆固醇在生物医学研究中具有广泛的应用领域醇Cholesterol-Cy5
2024.05.23
近红外荧光染料CY5标记胆固醇Cholesterol-Cy5针化合物
2024.05.23
Cholesterol-CY5胆固醇红色而荧光标记甾醇CY5羧基1032678-07-1
2024.05.23
新维创生物(重庆)有限公司 FITC-丝素蛋白绿色荧光标记,Silk fibroin,CAS:96690-41-4 ,Silk fibroin-FITC…
2024.05.18
重庆新维创生物 CY5-MAL马来酰亚胺的光学性质CY5红色荧光染料修饰1437796-65-0
2024.05.18
磺酸基CY5马来酰亚胺巯基反应性荧光染料Sulfo-CY5-MAL
2024.05.13
Sulfo-CY5-MAL︱2242791-82-6︱磺酸基团荧光染料衍生物在生物成像、化学分析的应用…
2024.05.13
阿霉素荧光修饰RB-Doxorubicin罗丹明标记阿霉素药物输送体内示踪
2024.05.11
赖氨酸FITC标记FITC-D-LYS荧光素标记赖氨酸绿色荧光异硫氰酸荧光素生物学应用…
2024.05.11
D-LYS-FITC荧光素标记赖氨酸 多肽标记绿色荧光异硫氰酸荧光素的应用
2024.05.11
FITC-D-LYS荧光素标记赖氨酸绿色荧光异硫氰酸荧光素修饰多肽
2024.05.11
CY5-amine/Cy5-NH2/氨基CY5的荧光特性1807529-70-9 Sulfo-CY5-amine磺酸基
2024.05.10
CY5-amine/Cy5-NH2/氨基CY5的化学性质近红外荧光染料CY5-NH2 1807529-70-9
2024.05.10
水溶性花菁染料Cy5标记链霉亲和素streptavidin
2023.11.24
水溶性CY5标记叠氮的原理
2023.11.24
荧光探针Sulfo-CY5-azide水溶性叠氮化物
2023.11.24
在氢谱中氨基为什么有两个峰?
2023.07.13
新维创生物汇总HNMR(核磁氢谱)化学位移0-14代表性官能团
2023.07.07
常用于核磁共振的氘代化学品
2023.07.03
NMR所需样品量和内标总结
2023.06.28
什么是核磁共振二维谱(2D NMR)?
2023.06.27
新维创生物利用核磁共振波谱仪分析聚合物结构
2023.06.27
你知道固体核磁和液体和磁的区别吗?
2023.06.20