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CY2-3-羟基丁酸,花青素短链CY2标记短链羟基脂肪酸

2025年10月29日 14:28 来源:

CY2:通常指一种荧光染料,属于花菁(Cyanine)染料家族。CY2 是一种绿色荧光染料,激发/发射波长约 490/505 nm,常用于生物标记。

3-羟基丁酸(3-Hydroxybutyric acid, 3HB):一种天然存在的短链羟基脂肪酸,化学式为 CHCH(OH)CHCOOH。它是酮体之一,也是聚-3-羟基丁酸(PHB)的单体,在代谢和生物材料中很重要。

因此,CY2-3-羟基丁酸”可能意指:一个 CY2 荧光染料通过化学连接,与 3-羟基丁酸偶联形成的探针分子。

但这并不是一个商品化或文献中常见的标准试剂,不像Sulfo-CY5-Alkyne”那样有明确定义。




2. 如果它是真实构建的分子,那它是什么?

假设这是一个人工设计的荧光探针,其结构可能是:

CY2 染料 — 连接臂(linker) — 3-羟基丁酸

类型:荧光标记的代谢物类似物。

目的:可能用于追踪 3-羟基丁酸在细胞中的代谢路径,或研究其与蛋白质的相互作用。




3. 两个部分的化学与物理属性

CY2 - 花菁类荧光染料: 激发/发射:490/505 nm(绿色),可溶于水或DMSO,含有活性基团(如NHS酯)用于偶联,3-羟基丁酸 - 分子式:CHO₃,分子量:104.1 g/mol,极性小分子,可溶于水,含有羟基(-OH)和羧基(-COOH),可参与化学反应。



4. 两者如何连接构建在一起?

如果要合成这样的分子,通常通过以下方式连接:

活化 CY2 的活性形式:如使用 CY2-NHS酯(N-羟基琥珀酰亚胺酯)。

利用 3-羟基丁酸的羧基或羟基进行偶联:

更可能的是:将 3-羟基丁酸的羟基保留,用其羧基与 CY2 上的氨基反应(需 CY2 带有氨基)。

或:将 CY2 NHS 酯与 3-羟基丁酸的羟基反应形成酯键(较不稳定)。

常用连接方式:通过酰胺键或酯键连接,中间可能加入 linker(如 PEG)以减少空间位阻。

示例反应:

CY2-NH+ HOOC-CH(OH)CHCH₃ → CY2-NH-CO-CH(OH)CHCH+ HO
(形成酰胺键)




5. 可能的问题与澄清

CY2”通常不直接用于偶联:商品化荧光染料多以 CY2-NHSCY2-hydrazide 等活性形式提供,用于标记含氨基或羰基的分子。

3-羟基丁酸反应性有限:只有一个羧基和一个羟基,偶联效率可能较低。

生物应用挑战:即使合成成功,该分子是否能被细胞识别为 3-羟基丁酸类似物,尚不确定。




结论

CY2-3-羟基丁酸 不是一个已知的标准化学物质。

它可能是设想中的一种 荧光标记的 3-羟基丁酸探针,由 CY2 荧光染料  3-羟基丁酸 通过共价键(如酰胺键或酯键)连接而成。

若需构建此类分子,需使用活性化的 CY2(如 CY2-NHS)与 3-羟基丁酸的官能团进行化学偶联,并验证其结构与功能。


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